ระบบบริหารงานด้านคุณภาพของสำนักยาและวัตถุเสพติดอยู่ภายใต้
► Certificate ISO/IEC 17025: 2017 Accredited Laboratory
► Certificate ISO/IEC 17043: 2010 Proficiency Testing Provider
► Certificate ISO 17034: 2016 General requirements for the competence of reference material producers
► นโยบายคุณภาพ ตามมาตรฐาน ISO 9001: 2015 Quality Management Systems
► นโยบายคุณภาพ ตามมาตรฐาน ISO/IEC 27001: 2022
► WHO List of Prequalified Quality Control Laboratories
หลักเกณฑ์วิธีการที่ดีสำหรับห้องปฏิบัติการควบคุมเภสัชภัณฑ์ องค์การอนามัยโลก (WHO good practices for pharmaceutical quality control laboratories)
► การพัฒนาคุณภาพการบริหารจัดการภาครัฐ (Public Sector Management Quality Award, PMQA)
► หนังสือรับรอง/ใบอนุญาต ตาม พ.ร.บ. เชื้อโรคและพิษจากสัตว์
- หนังสือรับรองการแจ้งผลิตเชื้อโรคและพิษจากสัตว์